Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp4O70480 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms