Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MttpO08601 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MttpO08601 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MttpO08601 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MttpO08601 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms