Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21310J3QQ23 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms