Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms