Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm933J3QPC1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms