Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm20795J3QP49 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm20795J3QP49 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm20795J3QP49 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm20795J3QP49 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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