Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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