Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc1E9Q043 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms