Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms