Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms