Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Usf3B2RUQ2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Usf3B2RUQ2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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