Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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