Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.5 ms