Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms