Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrit3W8DXL4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrit3W8DXL4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms