Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms