Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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