Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rnf4Q9QZS2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rnf4Q9QZS2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rnf4Q9QZS2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms