Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Tnnt3Q9QZ47 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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Tnnt3Q9QZ47 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Tnnt3Q9QZ47 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms