Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms