Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancaQ9JL70 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms