Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms