Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms