Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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