Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ush1cQ9ES64 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ush1cQ9ES64 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ush1cQ9ES64 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ush1cQ9ES64 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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