Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms