Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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Pop5Q9DB28 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Pop5Q9DB28 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop5Q9DB28 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms