Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms