Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms