Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B7

Prr30, Proline-rich protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr30Q9D9B7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr30Q9D9B7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms