Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms