Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Capns2Q9D7J7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms