Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn23Q9D7D7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn23Q9D7D7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn23Q9D7D7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn23Q9D7D7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn23Q9D7D7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn23Q9D7D7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn23Q9D7D7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms