Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc7Q9D541 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc7Q9D541 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc7Q9D541 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc7Q9D541 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc7Q9D541 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc7Q9D541 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc7Q9D541 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc7Q9D541 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc7Q9D541 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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