Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D131 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D131 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms