Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc47Q9D024 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc47Q9D024 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms