Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Exo5Q9CXP9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Exo5Q9CXP9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Exo5Q9CXP9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Exo5Q9CXP9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Exo5Q9CXP9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Exo5Q9CXP9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Exo5Q9CXP9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Exo5Q9CXP9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Exo5Q9CXP9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Exo5Q9CXP9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Exo5Q9CXP9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Exo5Q9CXP9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Exo5Q9CXP9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Exo5Q9CXP9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Exo5Q9CXP9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Exo5Q9CXP9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Exo5Q9CXP9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Exo5Q9CXP9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Exo5Q9CXP9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Exo5Q9CXP9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Exo5Q9CXP9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Exo5Q9CXP9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Exo5Q9CXP9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Exo5Q9CXP9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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