Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ddx28Q9CWT6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ddx28Q9CWT6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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