Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BccipQ9CWI3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BccipQ9CWI3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BccipQ9CWI3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BccipQ9CWI3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BccipQ9CWI3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BccipQ9CWI3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms