Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms