Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rprd1bQ9CSU0 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rprd1bQ9CSU0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rprd1bQ9CSU0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rprd1bQ9CSU0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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