Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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