Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Mrpl35Q9CQL6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Mrpl35Q9CQL6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Mrpl35Q9CQL6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Mrpl35Q9CQL6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Mrpl35Q9CQL6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Mrpl35Q9CQL6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Mrpl35Q9CQL6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Mrpl35Q9CQL6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Mrpl35Q9CQL6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Mrpl35Q9CQL6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Mrpl35Q9CQL6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl35Q9CQL6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Mrpl35Q9CQL6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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