Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms