Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Rnaseh2cQ9CQ18 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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