Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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NsmfQ99NF2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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NsmfQ99NF2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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NsmfQ99NF2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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