Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp1b4Q99ME6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms