Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms