Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TirapQ99JY1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TirapQ99JY1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TirapQ99JY1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TirapQ99JY1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TirapQ99JY1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TirapQ99JY1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms