Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf4Q8R368 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms